Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM99Q8N816 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM99Q8N816 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM99Q8N816 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM99Q8N816 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms