Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF148Q8N7C7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF148Q8N7C7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF148Q8N7C7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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