Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
OTUD6BQ8N6M0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTUD6BQ8N6M0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTUD6BQ8N6M0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTUD6BQ8N6M0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms