Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC13Q8IYE1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC13Q8IYE1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC13Q8IYE1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC13Q8IYE1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms