Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC6Q8IVU3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HERC6Q8IVU3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERC6Q8IVU3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC6Q8IVU3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms