Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC50Q8IVM0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC50Q8IVM0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC50Q8IVM0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC50Q8IVM0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms