Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y01

DTX1, E3 ubiquitin-protein ligase DTX1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX1Q86Y01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DTX1Q86Y01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DTX1Q86Y01 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DTX1Q86Y01 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DTX1Q86Y01 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX1Q86Y01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms