Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLNKQ7Z7G1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLNKQ7Z7G1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLNKQ7Z7G1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms