Protein–RNA interactions for Protein: Q71SY5

MED25, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 25, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED25Q71SY5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED25Q71SY5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED25Q71SY5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED25Q71SY5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED25Q71SY5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED25Q71SY5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED25Q71SY5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED25Q71SY5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED25Q71SY5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED25Q71SY5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED25Q71SY5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED25Q71SY5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED25Q71SY5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED25Q71SY5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED25Q71SY5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED25Q71SY5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED25Q71SY5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED25Q71SY5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED25Q71SY5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED25Q71SY5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms