Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS17

RIPOR1, Rho family-interacting cell polarization regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR1Q6ZS17 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPOR1Q6ZS17 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPOR1Q6ZS17 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPOR1Q6ZS17 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPOR1Q6ZS17 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms