Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRIG3Q6UXM1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRIG3Q6UXM1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRIG3Q6UXM1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRIG3Q6UXM1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRIG3Q6UXM1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRIG3Q6UXM1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRIG3Q6UXM1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRIG3Q6UXM1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRIG3Q6UXM1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRIG3Q6UXM1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIG3Q6UXM1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms