Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXF1

TMEM108, Transmembrane protein 108, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM108Q6UXF1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM108Q6UXF1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM108Q6UXF1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM108Q6UXF1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM108Q6UXF1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM108Q6UXF1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM108Q6UXF1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM108Q6UXF1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM108Q6UXF1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms