Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI47

KCTD18, BTB/POZ domain-containing protein KCTD18, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18Q6PI47 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD18Q6PI47 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD18Q6PI47 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD18Q6PI47 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD18Q6PI47 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD18Q6PI47 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD18Q6PI47 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD18Q6PI47 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD18Q6PI47 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD18Q6PI47 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD18Q6PI47 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD18Q6PI47 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD18Q6PI47 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD18Q6PI47 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD18Q6PI47 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCTD18Q6PI47 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD18Q6PI47 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD18Q6PI47 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD18Q6PI47 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD18Q6PI47 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD18Q6PI47 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD18Q6PI47 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD18Q6PI47 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD18Q6PI47 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD18Q6PI47 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD18Q6PI47 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms