Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN4Q6P4A7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN4Q6P4A7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN4Q6P4A7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFXN4Q6P4A7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN4Q6P4A7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms