Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBOX1Q6NT76 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMBOX1Q6NT76 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMBOX1Q6NT76 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMBOX1Q6NT76 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms