Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGB2Q6NT52 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGB2Q6NT52 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGB2Q6NT52 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGB2Q6NT52 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGB2Q6NT52 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms