Protein–RNA interactions for Protein: Q6N043

ZNF280D, Zinc finger protein 280D, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF280DQ6N043 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF280DQ6N043 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF280DQ6N043 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZNF280DQ6N043 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF280DQ6N043 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF280DQ6N043 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF280DQ6N043 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF280DQ6N043 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF280DQ6N043 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF280DQ6N043 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF280DQ6N043 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF280DQ6N043 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF280DQ6N043 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF280DQ6N043 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF280DQ6N043 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF280DQ6N043 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF280DQ6N043 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms