Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ETFRF1Q6IPR1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFRF1Q6IPR1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFRF1Q6IPR1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ETFRF1Q6IPR1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms