Protein–RNA interactions for Protein: Q68D42

TMEM215, Transmembrane protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM215Q68D42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM215Q68D42 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM215Q68D42 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM215Q68D42 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM215Q68D42 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM215Q68D42 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM215Q68D42 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM215Q68D42 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms