Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARMC3Q5W041 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARMC3Q5W041 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARMC3Q5W041 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARMC3Q5W041 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms