Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HES3Q5TGS1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES3Q5TGS1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES3Q5TGS1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES3Q5TGS1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES3Q5TGS1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HES3Q5TGS1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HES3Q5TGS1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HES3Q5TGS1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HES3Q5TGS1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HES3Q5TGS1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HES3Q5TGS1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HES3Q5TGS1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HES3Q5TGS1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HES3Q5TGS1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HES3Q5TGS1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HES3Q5TGS1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HES3Q5TGS1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HES3Q5TGS1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HES3Q5TGS1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HES3Q5TGS1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HES3Q5TGS1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HES3Q5TGS1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HES3Q5TGS1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HES3Q5TGS1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HES3Q5TGS1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HES3Q5TGS1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HES3Q5TGS1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HES3Q5TGS1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HES3Q5TGS1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HES3Q5TGS1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HES3Q5TGS1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms