Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC183Q5T5S1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC183Q5T5S1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC183Q5T5S1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC183Q5T5S1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms