Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCTE1Q5JU00 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTE1Q5JU00 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTE1Q5JU00 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTE1Q5JU00 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTE1Q5JU00 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCTE1Q5JU00 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTE1Q5JU00 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTE1Q5JU00 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms