Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MIA3Q5JRA6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MIA3Q5JRA6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIA3Q5JRA6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms