Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CAVIN4Q5BKX8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CAVIN4Q5BKX8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CAVIN4Q5BKX8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CAVIN4Q5BKX8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CAVIN4Q5BKX8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms