Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDCA8Q53HL2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDCA8Q53HL2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDCA8Q53HL2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDCA8Q53HL2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CDCA8Q53HL2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CDCA8Q53HL2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CDCA8Q53HL2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CDCA8Q53HL2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDCA8Q53HL2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CDCA8Q53HL2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CDCA8Q53HL2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDCA8Q53HL2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDCA8Q53HL2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDCA8Q53HL2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDCA8Q53HL2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CDCA8Q53HL2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CDCA8Q53HL2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CDCA8Q53HL2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CDCA8Q53HL2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CDCA8Q53HL2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CDCA8Q53HL2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CDCA8Q53HL2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CDCA8Q53HL2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CDCA8Q53HL2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CDCA8Q53HL2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CDCA8Q53HL2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CDCA8Q53HL2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CDCA8Q53HL2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CDCA8Q53HL2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CDCA8Q53HL2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CDCA8Q53HL2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CDCA8Q53HL2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDCA8Q53HL2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms