Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TPRNQ4KMQ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TPRNQ4KMQ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPRNQ4KMQ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TPRNQ4KMQ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPRNQ4KMQ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
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