Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SP6Q3SY56 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SP6Q3SY56 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP6Q3SY56 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP6Q3SY56 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms