Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BSXQ3C1V8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BSXQ3C1V8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BSXQ3C1V8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BSXQ3C1V8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BSXQ3C1V8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSXQ3C1V8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BSXQ3C1V8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSXQ3C1V8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BSXQ3C1V8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BSXQ3C1V8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BSXQ3C1V8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms