Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPEL1Q2QD12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPEL1Q2QD12 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms