Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRNQ16849 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRNQ16849 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRNQ16849 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRNQ16849 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms