Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR2Q16832 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR2Q16832 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDR2Q16832 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDR2Q16832 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR2Q16832 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR2Q16832 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR2Q16832 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDR2Q16832 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDR2Q16832 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR2Q16832 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR2Q16832 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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