Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3AQ16821 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3AQ16821 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3AQ16821 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3AQ16821 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3AQ16821 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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