Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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RAB11BQ15907 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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RAB11BQ15907 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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RAB11BQ15907 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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RAB11BQ15907 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11BQ15907 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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RAB11BQ15907 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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RAB11BQ15907 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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RAB11BQ15907 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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RAB11BQ15907 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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RAB11BQ15907 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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RAB11BQ15907 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11BQ15907 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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