Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP6AP1Q15904 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6AP1Q15904 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6AP1Q15904 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP6AP1Q15904 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6AP1Q15904 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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