Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USF2Q15853 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USF2Q15853 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USF2Q15853 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USF2Q15853 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USF2Q15853 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USF2Q15853 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USF2Q15853 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USF2Q15853 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USF2Q15853 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USF2Q15853 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USF2Q15853 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USF2Q15853 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USF2Q15853 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USF2Q15853 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USF2Q15853 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USF2Q15853 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USF2Q15853 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USF2Q15853 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USF2Q15853 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USF2Q15853 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USF2Q15853 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USF2Q15853 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USF2Q15853 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USF2Q15853 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USF2Q15853 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USF2Q15853 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USF2Q15853 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USF2Q15853 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USF2Q15853 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USF2Q15853 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USF2Q15853 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USF2Q15853 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USF2Q15853 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USF2Q15853 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USF2Q15853 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USF2Q15853 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USF2Q15853 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USF2Q15853 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USF2Q15853 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USF2Q15853 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USF2Q15853 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USF2Q15853 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USF2Q15853 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USF2Q15853 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USF2Q15853 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USF2Q15853 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USF2Q15853 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USF2Q15853 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USF2Q15853 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USF2Q15853 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USF2Q15853 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USF2Q15853 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USF2Q15853 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USF2Q15853 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USF2Q15853 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USF2Q15853 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USF2Q15853 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USF2Q15853 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USF2Q15853 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USF2Q15853 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USF2Q15853 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USF2Q15853 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USF2Q15853 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USF2Q15853 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USF2Q15853 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USF2Q15853 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USF2Q15853 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USF2Q15853 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USF2Q15853 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USF2Q15853 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USF2Q15853 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USF2Q15853 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USF2Q15853 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USF2Q15853 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USF2Q15853 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USF2Q15853 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USF2Q15853 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USF2Q15853 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USF2Q15853 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USF2Q15853 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USF2Q15853 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USF2Q15853 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USF2Q15853 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USF2Q15853 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USF2Q15853 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USF2Q15853 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USF2Q15853 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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