Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
NCOA1Q15788 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NCOA1Q15788 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NCOA1Q15788 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NCOA1Q15788 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NCOA1Q15788 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NCOA1Q15788 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NCOA1Q15788 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NCOA1Q15788 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
NCOA1Q15788 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NCOA1Q15788 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
NCOA1Q15788 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NCOA1Q15788 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NCOA1Q15788 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NCOA1Q15788 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NCOA1Q15788 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
NCOA1Q15788 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NCOA1Q15788 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NCOA1Q15788 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NCOA1Q15788 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
NCOA1Q15788 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
NCOA1Q15788 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NCOA1Q15788 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NCOA1Q15788 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NCOA1Q15788 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NCOA1Q15788 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NCOA1Q15788 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NCOA1Q15788 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NCOA1Q15788 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NCOA1Q15788 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
NCOA1Q15788 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NCOA1Q15788 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
NCOA1Q15788 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
NCOA1Q15788 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
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