Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIP11Q15643 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIP11Q15643 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIP11Q15643 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIP11Q15643 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIP11Q15643 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIP11Q15643 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms