Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP10Q15642 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP10Q15642 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP10Q15642 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP10Q15642 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP10Q15642 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms