Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms