Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TTF1Q15361 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TTF1Q15361 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TTF1Q15361 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TTF1Q15361 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TTF1Q15361 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TTF1Q15361 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TTF1Q15361 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TTF1Q15361 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TTF1Q15361 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TTF1Q15361 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TTF1Q15361 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TTF1Q15361 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TTF1Q15361 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
TTF1Q15361 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TTF1Q15361 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
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