Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
PTPRKQ15262 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
PTPRKQ15262 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.87
PTPRKQ15262 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
PTPRKQ15262 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PTPRKQ15262 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PTPRKQ15262 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PTPRKQ15262 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
PTPRKQ15262 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
PTPRKQ15262 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PTPRKQ15262 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PTPRKQ15262 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRKQ15262 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PTPRKQ15262 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.86
PTPRKQ15262 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PTPRKQ15262 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PTPRKQ15262 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PTPRKQ15262 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PTPRKQ15262 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PTPRKQ15262 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PTPRKQ15262 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PTPRKQ15262 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRKQ15262 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRKQ15262 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRKQ15262 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PTPRKQ15262 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
PTPRKQ15262 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PTPRKQ15262 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRKQ15262 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRKQ15262 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRKQ15262 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PTPRKQ15262 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
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