Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDCD1Q15116 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD1Q15116 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD1Q15116 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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