Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNC3Q14003 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNC3Q14003 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KCNC3Q14003 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNC3Q14003 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNC3Q14003 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNC3Q14003 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNC3Q14003 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
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