Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTCH1Q13635 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTCH1Q13635 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PTCH1Q13635 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTCH1Q13635 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTCH1Q13635 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTCH1Q13635 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PTCH1Q13635 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTCH1Q13635 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTCH1Q13635 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTCH1Q13635 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTCH1Q13635 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PTCH1Q13635 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTCH1Q13635 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTCH1Q13635 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PTCH1Q13635 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTCH1Q13635 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTCH1Q13635 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTCH1Q13635 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTCH1Q13635 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTCH1Q13635 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTCH1Q13635 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTCH1Q13635 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
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