Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MTMR1Q13613 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTMR1Q13613 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MTMR1Q13613 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MTMR1Q13613 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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