Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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