Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRR1Q13601 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRR1Q13601 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRR1Q13601 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms