Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUSC3Q13454 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUSC3Q13454 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUSC3Q13454 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUSC3Q13454 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUSC3Q13454 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUSC3Q13454 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUSC3Q13454 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUSC3Q13454 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUSC3Q13454 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUSC3Q13454 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUSC3Q13454 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUSC3Q13454 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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TUSC3Q13454 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUSC3Q13454 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUSC3Q13454 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUSC3Q13454 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TUSC3Q13454 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TUSC3Q13454 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUSC3Q13454 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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TUSC3Q13454 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUSC3Q13454 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUSC3Q13454 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUSC3Q13454 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUSC3Q13454 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
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TUSC3Q13454 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
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TUSC3Q13454 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUSC3Q13454 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TUSC3Q13454 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUSC3Q13454 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUSC3Q13454 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
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