Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSLNQ13421 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSLNQ13421 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MSLNQ13421 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
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