Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRSQ13332 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRSQ13332 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
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PTPRSQ13332 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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PTPRSQ13332 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRSQ13332 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRSQ13332 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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PTPRSQ13332 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
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PTPRSQ13332 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRSQ13332 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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PTPRSQ13332 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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PTPRSQ13332 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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PTPRSQ13332 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
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